根据《中华人民共和国增值税法》第六条规定“有下列情形之一的，不属于应税交易，不征收增值税：(二)收取行政事业性收费、政府性基金”。根据《中华人民共和国增值税法实施条例》第十五条规定“增值税法第十七条所称全部价款，不包括纳税人代为收取的下列税费或者款项：(一)政府性基金或者行政事业性收费”。
根据财政部发布的《全国性及中央部门和单位行政事业性收费目录清单》，以及财政部等部门印发的《财政部 国家发展改革委 住房城乡建设部关于印发〈污水处理费征收使用管理办法〉的通知》(财税〔2014〕151号)，“污水处理费”属于城镇排水主管部门收取的行政事业性收费。因此，对相关政府主管部门按照财税〔2014〕151号文件等规定收取污水处理费，不属于应税交易，不征收增值税。
根据财税〔2014〕151号文件第十三条规定“使用公共供水的单位和个人，其污水处理费由城镇排水主管部门委托公共供水企业在收取水费时一并代征，并在发票中单独列明污水处理费的缴款数额。城镇排水主管部门应当与公共供水企业签订代征污水处理费合同，明确双方权利义务。”因此，对相关政府主管部门与自来水厂(公司)签订代征合同，委托自来水厂(公司)随水费收取的污水处理费，不属于自来水厂(公司)的销售额，不征收增值税。